Ну смотрите, вообще любой нормальный плеер когда начинает играть запрашивает фокус себе, чтобы другие приложения приостановили проигрывание, когда происходит звонок приложение телефон также забирает аудио фокус себе, ваше задача отловить этот момент, при внедрении этого кода, ваше приложение будет останавливать проигрывание когда потеряет фокус. Во первых это единственно правильный метод. Во вторых ваше приложение будет останавливать проигрывание и при запуске видео в Ютуб, или входящем звонке с мессенджеров.
Думаю, что правильнее и проще всего будет добавить в приложение ресивер, и подписаться на событие входящего вызова, ну, и далее, скажем, в сервис интент отправить, или в приложение, или еще что сделать