В своих программах всегда использую https. Всегда отвечал нет, все проходило. При использовании https не нужно указывать шифрование, это пишут и на стэке. В основном рекомендуют отвечать Да, если вы используете Apple библиотеки для шифрования (Security framework, CommonCrypto).
Я вообще не вижу проблемы. Отвечайте "Нет", это ускорит процесс рассмотрения.
Очень низкая вероятность того что вас забанят из за того что неправильно указаны пункты в анкете, просто не пропустят программу до исправления причины.